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Módulo 1: Fundamentos de biología de sistemas
- Presentación de la plataforma
- Presentación del curso y bienvenida
- Clase 1: Agenda y objetivos
- Clase 1: Contexto de la biología de sistemas.
- Clase 1: Niveles en biología de sistemas y ciencias ómicas.
- Clase 2: Agenda y objetivos.
- Clase 2: Métodos experimentales: Secuenciación de ADN y ARN y Microarreglos de ADN.
- Clase 2: Métodos experimentales: Espectrometría de masas y Cromatografía líquida de alto rendimiento.
- Clase 2: Métodos experimentales: Citometría de flujo y de masa e Imagenología por fluorescencia.
- Clase 2: Enfoques en Biología de Sistemas: Top-Down y Bottom-Up.
- Validación de conocimientos – Clases 1 y 2
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Módulo 2: Enfoque Top-Down: Modelos Estadísticos
- Clase 3: Agenda y objetivos: Modelos estadísticos
- Clase 3: Modelos estadísticos: desafíos y soluciones
- Clase 3: Introducción a RStudio
- Clase 3: Paquetes y repositorios para RStudio.
- Clase 3: Caso práctico inicial RStudio.
- Clase 4: Agenda y objetivos: Regresión lineal simple
- Clase 4: Implementación Regresión lineal simple
- Clase 4: Regresión lineal múltiple
- Clase 4: Implementación Regresión lineal múltiple
- Validación de conocimientos – Clases 3 y 4
- Clase 5: Agenda y objetivos: Regresión logística
- Clase 5: Regresión logística
- Clase 6: Agenda y objetivos: Análisis de componentes principales
- Clase 6: Análisis de componentes principales (PCA)
- Validación de conocimientos – Clases 5 y 6
- Clase 7: Agenda y objetivos: Clustering
- Clase 7: Clustering
- Clase 8: Redes en biología de sistemas (Encuentro sincrónico)
- Validación de conocimientos – Clases 7 y 8
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Módulo 3: Enfoque Bottom-Up: Modelos Matemáticos
- Clase 9: Agenda y Objetivos
- Clase 9: Introducción enfoque Bottom-Up.
- Clase 9: Instalación y Recursos de Octave
- Clase 9: Interfaz y manejo básico de Octave.
- Clase 9: Declaración de variables y operaciones básicas en Octave.
- Clase 10: Agenda, objetivos e introducción al modelado con ecuaciones diferenciales
- Clase 10: Ley de Acción de Masas
- Clase 10: Aproximación de Michaelis-Menten
- Clase 10: Obtención y solución del sistema de ODEs
- Validación de conocimientos – Clases 9 y 10
- Clase 11: Estabilidad y biestabilidad (Encuentro sincrónico)
- Clase 12: Agenda, objetivos y el ciclo celular fácil y rápido
- Clase 12: Modelado y simulación del ciclo celular.
- Clase 12: Sistema de ecuaciones para ciclo celular.
- Validación de conocimientos – Clases 11 y 12
- Clase 13: Agenda, Objetivos y Señalización
- Clase 13: Conceptos Básicos de Electroquímica
- Clase 13: Modelo de Hudgkin & Huxley y modelo de Fitzhugh-Nagumo
- Clase 14: Modelos basados en PDEs y Modelos estocásticos (Encuentro sincrónico)
- Validación de conocimientos – Clases 13 y 14
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